肿瘤结构变异 5% FFPE标准品
产品名称： 肿瘤结构变异 5% FFPE标准品
英文名称： Onco Structural Multiplex 5% FFPE DNA
产品编号： GW-OPSM002
产品价格： 0
产品产地： 深圳
品牌商标： GeneWell
更新时间： null
使用范围： null
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产品介绍
FFPE是活检标本的一种保存和制备方式，有助于实验研究和诊断流程/药物开发。首先通过将组织样品固定在甲醛（也称为福尔马林）中来保存，以保护组织内的蛋白质和重要结构。接下来，将其嵌入石蜡块中，这样可以更容易地切割所需尺寸的切片，以便安装在显微镜载玻片上进行相关实验。
肿瘤结构变异 5% FFPE 标准品是一种高度特征化，生物学相关的FFPE质量控制材料，涵盖多种基因变异，包含SNP和插入，缺失，拷贝数变异，基因融合等突变类型，用于评估从样本提取到定量的全流程各步骤，有助于修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等，并进行后续的一系列应用。
详细信息
|
突变类型 |
突变位点 |
突变频率 |
COSMIC编号 |
CDS突变 |
染色体编号 |
染色体位置 |
|
SNV High GC |
AKT1 E17K |
5% |
COSM33765 |
c.49G＞A |
14 |
104780214 |
|
SNV Low GC |
PIK3CA E545K |
5% |
COSM763 |
c.1633G＞A |
3 |
179218303 |
|
Long Insertion |
EGFR_V769_D770insASV |
5% |
COSM12376 |
c.2307_2308insGCCAGCGTG |
7 |
55181316-55181317 |
|
Long Deletion |
EGFR_ΔE746-A750 |
5% |
COSM6223 |
c.2235_2249del15 |
7 |
55174772-55174786 |
|
Fusion |
CD74-ROS1 translocation |
5% |
COSF1200 |
NA |
6,5 |
117700222,149782188 |
|
Fusion |
EML4-ALK translocation |
5% |
COSF734 |
NA |
2,2 |
42472827,29446394 |
|
CNV |
MET amplification |
3.5 copies |
NA |
NA |
7 |
116672196-116798386 |
|
CNV |
HER2 amplification |
7.0 copies |
NA |
NA |
17 |
39687914-39730426 |
QC标准
|
检测项目 |
检测方法 |
质量标准 |
|
等位基因突变频率 |
伯乐 QX200微滴式数字PCR |
AF＝0，可接受AF≤0.1% ； AF＜1%，可接受误差范围＝±40%； 1%≤AF≤5%，可接受误差范围＝±30%； 5%＜AF≤20%，可接受误差范围＝±20% ； 20%＜AF，可接受误差范围＝±10%； 拷贝数变异＜5，可接受误差范围= ±10% ； 5≤拷贝数变异＜10，可接受误差范围＝±30%； 10≤拷贝数变异，可接受误差范围＝±20% |
|
基因型 |
Sanger |
检出突变 |
|
质量 |
琼脂糖凝胶电泳 |
电泳条带清晰明亮 |
|
定量 |
Qubit® dsDNA BR assay (DNA) |
≥400 ng/片(Maxwell® 16 FFPE plus LEV DNA Purification Kit (Promega)) |
|
RNA表达（FFPE RNA） |
End-Point RT-PCR |
目标区域出现清新明亮的条带，而阴性对照组在目标区域不出现条带 |
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