疫苗设计主要依赖蛋白序列预测与免疫学实验，然而在面对复杂病原体（如病毒突变株或肿瘤新抗原）时，这种策略常因抗原识别不精确而受限。免疫肽组学（Immunopeptidomics）——这一融合质谱技术与免疫生物学的新兴领域，正在为高效疫苗设计和精准靶点筛选提供革新手段。

一、什么是免疫肽组学？

1、核心概念解析

免疫肽组学是指通过质谱技术系统分析MHC分子（主要组织相容性复合体）呈递的内源性肽段，从而识别在自然免疫状态下可被T细胞识别的真实抗原。这一研究策略可用于揭示病毒感染、肿瘤、免疫疾病等多种状态下的抗原呈递特征。

2、与传统预测方法的区别

传统方法依赖生物信息预测潜在T细胞表位，但实际MHC加载与TCR识别之间存在巨大偏差。免疫肽组学则通过直接富集MHC复合物并进行肽段解析，可获得更具生理相关性的数据，显著提升靶点筛选的准确性。

二、技术流程：从细胞到抗原肽的精准解析

1、关键步骤包括

（1）MHC免疫共沉淀：使用特异性抗体富集目标MHC分子。

（2）肽段洗脱与纯化：在非变性条件下洗脱肽段，避免蛋白污染。

（3）高分辨质谱检测：采用Orbitrap或TIMS-TOF等平台进行高灵敏分析。

（4）数据库匹配与鉴定：结合HLA配型信息进行肽段反推与来源蛋白注释。

2、挑战与对策

（1）MHC种类多样 → 需精确匹配个体HLA型

（2）肽段量极低 → 样本前处理与质谱灵敏度成为关键

（3）数据分析复杂 → 依赖专业算法和经验数据库支持

三、应用场景：免疫肽组学在疫苗设计中的多重价值

1、病毒疫苗的抗原识别与突变监测

在流感、SARS-CoV-2等病毒疫苗开发中，免疫肽组学可识别出自然感染后真正呈递的表位肽段，指导mRNA疫苗编码区域选择；同时可用于突变毒株表位逃逸风险评估，为疫苗迭代提供参考。

2、肿瘤新抗原筛选

肿瘤细胞常呈递肿瘤特异性突变肽（neoantigen）。通过免疫肽组学，研究者可直接鉴定MHC加载的新生抗原，为个体化肿瘤疫苗设计提供精确靶点。

3、自身免疫与耐受研究

识别疾病相关MHC呈递肽段有助于揭示免疫失衡的分子基础，对治疗性疫苗开发（如自身免疫耐受疫苗）也具有指导意义。

百泰派克生物科技的免疫肽组学服务优势

百泰派克生物科技搭建了高通量免疫肽组学平台，整合MHC富集技术与高灵敏质谱系统，可实现：

* 多种人类与小鼠HLA/MHC类型的兼容检测

• 单细胞量级肽段的富集与定量
• 精准的HLA分型结合肽段数据库匹配
• 肽组学与蛋白组学、转录组学联合分析，提升靶点筛选效率

我们致力于为疫苗研发、免疫治疗、生物标志物开发等方向提供高质量科研支持，助力客户精准识别具有临床价值的免疫靶点。免疫肽组学作为连接分子层面抗原呈递与临床免疫干预的重要桥梁，正成为疫苗研发不可或缺的关键工具。在未来的个体化医疗与防控策略中，其价值将更加凸显。百泰派克生物科技将持续深化在多组学整合与免疫分析方向的技术布局，为疫苗科学与免疫治疗注入新动力。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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