蛋白从头测序质谱分析是一种利用质谱技术直接解析蛋白质一级结构的高效方法，主要用于没有基因组信息支持的样本分析，或者需要确认已知序列中未知修饰、变异或加工修饰的具体位置。传统的蛋白质测序方法依赖于已知的基因组或转录组数据进行序列比对，而蛋白从头测序质谱分析则能够从头开始，直接通过实验数据推导出蛋白质的氨基酸序列。这一技术突破在蛋白质组学、生物制药、结构生物学以及农业和食品科学领域均具有意义。蛋白从头测序质谱分析的关键在于通过高分辨率质谱仪对蛋白质样本进行多级质谱（MS/MS）分析，获得肽段碎片的质量信息，并利用这些信息重建完整的氨基酸序列。与传统依赖数据库的肽段匹配不同，从头测序依靠算法将碎片离子的质量数据拼接起来，逐步推导出每个肽段的序列。这一技术在分析非模式生物、未知蛋白或者具有复杂翻译后修饰的蛋白时具有独特优势，因为它无需依赖预设的序列数据库，能够更加灵活和全面地捕捉蛋白质的序列信息。

一、蛋白从头测序质谱分析应用领域

1、非模式生物研究：在许多非模式生物中，基因组或转录组数据不完善甚至缺失；通过蛋白从头测序可以直接获取关键蛋白的序列信息，用于功能研究或生物标志物开发。例如，在研究某些珍稀动植物、微生物或古生物样本时，蛋白从头测序质谱分析能够提供宝贵的分子数据。

2、抗体序列解析：在生物制药领域，抗体药物的序列信息对于药物开发和质量控制至关重要。蛋白从头测序质谱分析能够精准解析抗体的重链和轻链序列，为抗体药物的开发、优化及专利申请提供核心支持。

3、翻译后修饰研究：蛋白质常伴随着翻译后修饰（PTMs），如磷酸化、糖基化或甲基化等，这些修饰会显著影响蛋白质的功能；蛋白从头测序质谱分析能够精确定位修饰位点并揭示修饰模式及其生物学意义。

4、食品与农业科学：在食品安全和农业研究中，通过蛋白从头测序分析可鉴定特定的蛋白质标志物，例如食品中潜在的过敏原蛋白或者某些农作物中特异表达的功能蛋白。

二、蛋白从头测序质谱分析的技术流程

1、蛋白质样本制备：将复杂的蛋白质样本通过酶切（如胰蛋白酶、糜蛋白酶）分解成较短的肽段以便于后续的质谱分析。

2、质谱检测：利用高分辨率质谱仪对样本进行多级质谱分析，生成肽段的碎片离子图谱。这些碎片离子图谱记录了肽段的碎裂模式，包含蛋白质序列的信息。

3、序列推导：通过专业的生物信息学算法解析碎片离子图谱，重建每条肽段的氨基酸序列。这一过程需要严格控制误差，确保序列准确性。

4、序列拼接与验证：通过整合多个肽段的序列信息，重建完整蛋白质的一级结构，同时对所得序列进行实验验证，确保结果的可靠性。

百泰派克生物科技在蛋白从头测序领域拥有丰富经验，能够为客户提供一站式的高质量服务。从样本处理到数据解析，我们始终致力于精准还原蛋白质的全序列信息，助力科学家和企业解决复杂蛋白质解析的难题。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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