该系统主要应用于病原体的检测和基因诊断，包括威胁公共卫生和健康的病毒和细菌等病原体的检测，遗传病基因突变检测， mRNA,miRNA表达图谱研究，免疫组库多样性分析，同时还能够应用于环境监测，包括水质、空气的污染；检验检疫工作，食品卫生检验等。

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