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【展后速递】创新型酶法甲基化产品eTAPS亮相P4引关注

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2021-10-25T18:59 (访问量:14463)

【展后速递】创新型酶法甲基化产品eTAPS亮相P4引关注

2021年10月22日,第五届国际肿瘤精准医疗大会在北京朝阳悠唐**假日酒店盛大开幕。翌圣生物携创新型甲基化酶法转化试剂盒eTAPS亮相大会,引发行业关注。本次大会设有会场A:肿瘤早筛/辅助早诊/分型/预后等技术创新与应用以及会场B:肿瘤创新药物疗法与标志物/伴随研究的精准开发转化两个分会场。结合当下的肿瘤精准医疗大环境,深度探讨CDx模式,LDT合规化路径,液体活检,肿瘤早筛等热点话题,吸引近600名观众齐聚现场,共话肿瘤精准诊疗。

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翌圣生物高级产品经理徐正出席峰会并在肿瘤早诊早筛分会场分享了主题为“eTAPS酶法转化技术在甲基化检测中的应用”精彩演讲,从上游原料商的角度分享了新型的甲基化转化技术在未来早筛市场的应用。首先从肿瘤早筛早检是降低死亡率的重要路径入手,引申到基于ctDNA的甲基化检测是当前主流的早筛技术路径。进而讲述翌圣在甲基化检测领域的的相关工作。

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Bisulfite化学法转化是目前甲基化检测最主流的前处理方案

甲基化检测中需要前处理的转化,即区分甲基化的胞嘧啶以及非甲基化的胞嘧啶。目前主流方案是通过Bisulfite处理,转化效率高达99%甚至以上,但是其也有最为明显的不足,会对DNA造成剧烈的损伤,且最终的回收率往往不足10%,这在一些珍稀样本中如cfDNA中应用相对困难。此外,由于是将非甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,这会导致最终的文库出现碱基失衡的现象。

Bisulfite化学法转化是目前甲基化检测最主流的前处理方案.jpg


前人的探索:甲基化检测的“阴”与“阳”

在这过程中,不少企业学者已经基于此进行探索,比如NEB公司的EM-Seq技术,以及2019年发表的TAPS技术等。

前人的探索:甲基化检测的“阴”与“阳”.jpg
EM-seq采用酶法转化,但这也仅仅是降低了反应的剧烈性,本质上其与Bisulfite处理是同一种原理,不但未解决碱基失衡的问题,反而使得操作比Bisulfite更麻烦。此后也有学者提出了TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)技术,基本能解决传统Bisulfite以及EM-seq的不足。但依旧存在自己的问题,比如转化率不高,操作繁琐以及难以适应自动化等问题。
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基于此,目前翌圣开发的eTAPS转化技术可作为未来理想的替换方案。通过定向进化获得高活性高质量的eTeT1酶,以及对于流程的精简优化,目前可实现一次氧化,单管操作磁珠回收,可完美适配未来自动化的需求。

目前基于内部的评测体系,eTAPS转化效率、DNA回收效率以及错误率均优于Bisulfite,可作为其理想的替换方案。未来基于eTAPS的应用,还可延伸至三代测序领域。


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当然,基于eTAPS目前依旧缺乏足够的终端应用场景去进行相关验证,目前也仅是走出了第一步,我们也希望同下游客户一起共同开发,推进eTAPS在肿瘤早筛早诊技术领域的应用。

展区现场,翌圣生物相关技术负责人也想诸多的参观者介绍了eTAPS目前相关的进展与数据,以及公司NGS相关产品完整的解决方案。


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