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《自然》杂志精选

作者:上海研辉生物科技有限公司 2011-08-22T00:00 (访问量:2754)

封面故事:细菌之间的“决斗”

“VI型分泌系统”(T6SS)是一个蛋白输出机器,存在于大约四分之一所有已测序的细菌中。细菌能利用这一系统来以一种依赖于接触的方式向其他细菌细胞提供有毒效应子蛋白。然而,这些蛋白在到达其目的地之后做什么在很大程度上仍不知道。现在,研究表明,“机会主义者”人病原体“绿脓杆菌”利用其T6SS来杀死竞争对手“革兰氏阴性细菌”,其方法是向其注射两种肽聚糖降解酶:效应子蛋白Tse1和Tse3。“绿脓杆菌”通过表达能与这些效应子相结合的免疫蛋白来保护自己不受其影响。本期封面上描绘了细菌之间的一场冲突。从一个供体细胞(红色)输送到一个受体细胞(绿色)的T6SS效应子蛋白使细胞壁降解,导致受体细胞的肽聚糖层中出现一道裂缝。“决斗”中的“革兰氏阴性细菌”的外膜没有在图片上显示出来,所以其下面的肽聚糖层是可以看得见的。

“后光时代”基因组测序芯片

更便宜、更小巧的DNA测序设备的研制受到若干因素的限制,其中包括对成像技术的需求。一项新的DNA测序技术不需要用光学方式读取数据,而是通过直接感应由模板引导的DNA合成所产生的氢离子来获取序列数据。该技术提供了一个在大规模并行半导体感应设备上或离子芯片上进行低成本、规模化测序的途径。相关反应都是用天然核苷酸进行的,各个离子敏感性芯片都是一次性的,价格都不高。该系统已用于对三个细菌基因组和一个人基因组进行测序。

用喷墨方式打印半导体薄膜

利用半导体“墨水”来打印电子器件,被看做是制造廉价、大面积、柔性电子器件的一个很有希望的途径,但这类器件的性能却受到打印上去的材料结晶性能较差的限制。Hiromi Minemawari及其同事开发出一种喷墨打印技术,它涉及在一个表面上对两种溶液进行受控混合—— 一种是处在其溶剂中的半导体(C8-BTBT);另一种是一种液体,在该液体中这种半导体是不溶的。用这种反溶剂结晶技术所得到的是具有极高的、均匀的结晶性能的半导体薄膜。

一个可编程的DNA网络

在基于神经元的大脑形成之前,复杂的生物分子回路一定已赋予了各个细胞能够确保生存的智能行为。但关于分子何以能够“思考”的研究工作,迄今尚未产生能够模仿即便是单一神经元的有用的、基于分子的计算系统。在一项横跨DNA纳米技术、DNA计算以及合成生物学等领域的研究中,Qian等人将DNA用作一种工程材料,来构建具有自主的、像大脑一样的行为的计算电路。这个研究小组利用一个简单的“DNA门”架构来生成能够起被称为“Hopfield联想式记忆装置”作用的反应级联,这种级联能够被训练来“记忆”DNA模式,并且在给出一个不完全的模式时能够回忆起最相似的一个模式。

日本东北地震区域GPS数据分析

对来自由“日本国土地理院”管理的一个网络的“全球定位系统”(GPS)数据所作的详细分析,提供了一个关于日本近海“大型逆冲区”断层上震时和震后走滑的分布情况记录,2011年3月11日在这个地方发生了9级地震。震时走滑区域沿日本海沟延伸约400公里,相当于震前锁定区域的面积。震后走滑区域目前正在与震时走滑区域重叠,并向周围区域扩展。本文作者们得出结论认为,这样的测地数据有可能帮助改进对其他消减带发生地震的可能性进行预测的工作。

寻求奖励过程中的脑功能

杏仁基底外侧核(BLA)和伏膈核(NAc)之间的相互作用涉及到若干奖励处理及上瘾行为中,但我们对这些大脑区域中每一个的精确作用的认识,一直受限于不能够在行为发生过程中对通道进行选择性操纵。Stuber等人利用光遗传学技术(在这些技术中,光选择性地激发或抑制在遗传上定义的神经元亚类)发现了BLA(传统上被与令人厌恶的行为关联在一起的一个大脑区域)的一个出乎意料的作用。

植物生物钟的工作机制

在植物中,生物钟起一个内在的步调调控器的作用,来对变化中的环境进行预测和作出反应,以便优化生理及发育事件的时机。Nusinow等人阐述了生物钟控制模型植物拟南芥生长的机制。被称为“夜晚复合物”的一种新颖的三聚体复合物由生物钟调控,在黄昏时其表达程度最高。该复合物抑制两个转录因子PIF4和PIF5的表达,这两个转录因子是一个光信号作用级联的构成部分,该级联根据光照条件控制植物生长的时机。(生物谷 Bioon.com)

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