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“华工—华大”基因组创新班再亮剑

作者：上海研吉生物科技有限公司 2011-09-07T00:00 (访问量:2863)

华南理工大学与深圳华大基因研究院基因组科学创新班近日再传捷报。由2007级本科生罗锐邦作为并列第一作者，2010级硕士生黄树嘉、2007级本科生张帆作为署名作者，华南理工大学作为第二完成单位，深圳华大基因研究院主要承担的《基于全基因组组装数据检测人类基因组结构变异》高水平研究成果在国际顶尖科学期刊《自然》的生物技术分刊（Natureiotechnology）上刊出。

据介绍，该项研究采用新一代测序技术获得的全基因组组装的短片段构建了一个亚洲人和一个非洲人详尽的结构变异图谱，为人类基因组结构变异检测提供了一种新方法——基于全基因组组装的结构变异检测，该方法与其他检测方法相比具有性价比高、速度快等优点。据称，该方法可检测到1~50k范围内不同长度的结构变异，包括插入、缺失、倒置、基因重排等。在该研究中，研究人员在亚洲人和非洲人的个人基因组组装区域（1~23k）共检测到27万多个结构变异，并对这些变异进行了验证，结果表明，该方法具有高准确度的特点。同时，研究人员还对这些结构变异的特性和生物学作用相关方面进行了研究。该项研究首次证实，基于全基因组组装的结构变异检测方法是可行的，而且具有准确度高、检测SV长度范围广以及可以更好地检测到一些更复杂的SV序列等优势。该研究对全面理解结构变异和它们对基因组进化和生物学方面的影响具有十分重要的意义。

罗锐邦是华南理工大学生物科学与工程学院生物工程专业学生，作为“华工—华大”基因组科学创新班第一届学员，他曾于2009年12月在《自然》的生物技术分刊上以并列第一作者身份发表高水平研究成果《构建人类泛基因组序列图谱》。

罗锐邦告诉记者，目前自己主要从事使用计算和分子生物学技术研究杂合子二倍体基因组的组装方面的研究。这一项目的研究团队，除了罗锐邦为该项目的主要负责人之一，参与并指导各项具体分析工作，还包括4位华南理工大学学子，以及该校生物科学与工程学院教师杜红丽。在2007级毕业生走上人生新起点之际，罗锐邦自豪地表示，这篇论文的发表，是他和他的团队给母校的献礼。

据了解，自2009年3月“华工—华大”基因组科学创新班成立以来，共有20人次分别以并列第一作者等身份在国际顶尖学术杂志上发表高水平学术论文13篇。他们绝大部分为在校本科生。这一现象得到了学界和社会的高度关注，《自然》曾专门就此刊发社论文章《科学家是否需要博士学位？》，认为该创新班的全新人才培养模式“可能为教育和培训体制带来一场革命”。

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